一、外形
1、北瓜：茎有半透明的粗糙毛。卷须分叉。叶纸质，三角形或卵状三角形。花雌雄同株，单生，黄色。果实形状因品种而异，种子白色。北瓜颜色深绿，瓜型较小或弯长。
2、南瓜：茎常节部生根，叶柄粗壮，叶片宽卵形或卵圆形，质稍柔软，叶脉隆起，卷须稍粗壮，雌雄同株，果梗粗壮，有棱和槽，外面常有数条纵沟或无，种子多数，长卵形或长圆形。
二、分布
1、北瓜：最初种植于以北京为中心的北方地区，今中国河南、河北、四川、山东、安徽等大部分地区都有种植。
2、南瓜：原产墨西哥到中美洲一带，世界各地普遍栽培。明代传入中国，现南北各地广泛种植。
三、营养价值
1、北瓜：北瓜含有淀粉、蛋白质、胡萝卜素、维生素B、维生素C和钙、磷等成分。性味甘平，无毒，具有润肺止喘功效。
2、南瓜：南瓜富含多糖类、类胡萝卜素、果胶、矿质元素、氨基酸等。南瓜的果实作肴馔，亦可代粮食。全株各部又供药用，种子含南瓜子氨基酸，有清热除湿、驱虫的功效，对血吸虫有控制和杀灭的作用。
北瓜和南瓜的区别：外形不同，南瓜都是圆形的，而北瓜长成圆的、细长的、扁的形状。种植方法不同，南瓜可吊起来种植，北瓜一般是在地上种植。
味道不同，南瓜比较甜，北瓜水分比较大，味道比较差。
营养价值不同，南瓜含有多糖类物质、矿物质元素等，营养价值丰富一些，北瓜含有丰富的纤维素、能提高人体免疫能力。