1、从根须来看，有根豆芽是有根须的，或者有支根突起，无根豆芽没有根须。
2、从培育期来看，有根豆芽属于传统方法培育，培育期比无根豆芽要长。
3、从安全性来看，有根豆芽多为农民种植养成，属于有机食品，而无根豆芽除了用无根水培育外，有些商家还添加了其他物质，比如漂白剂，安全性较低。
黄豆芽与绿豆芽的区别
1、颜色上的不同。
黄豆芽是黄豆经过泡发而成的豆芽，豆瓣是黄色的，绿豆芽就是绿豆经过泡发的豆芽，豆瓣是绿色的。
2、外形不同。豆瓣大小的不同，黄豆芽比绿豆芽的豆瓣大一些，黄豆芽的根茎比绿豆芽的根茎更粗一些。
3、含水量上的不同。
绿豆芽的重量要比黄豆芽的重量高，绿豆芽的含水量比黄豆芽的高。
4、营养价值不一样。
黄豆芽的粗纤维比绿豆芽高，绿豆芽的叶绿素和维生素C更高。
5、烹饪方法不同。
黄豆芽的根茎非常粗，水分非常足，适合炒菜和煲汤，绿豆芽比较容易熟，适合用来凉拌，从口感而言，绿豆芽更嫩更软一些，但是黄豆芽的口感更脆一些。
黄豆芽是由黄豆泡发而成的，它的根相对粗一些，豆芽的豆瓣大，颜色为黄色；绿豆芽是由绿豆泡发而成的，它的根相对细一些，绿豆芽豆瓣相对偏小，颜色为绿色。黄豆芽适合与肉类食品炖煮烹饪，耐煮，绿豆芽由于细嫩适合清炒，口感清脆。