两者都是根茎类植物，淀粉含量高，蛋白含量低。不同之处：木薯粉中一般含有氢氰酸，有毒，须经水浸泡后煮熟放能食用；而麻薯粉中不含有氢氰酸，可以食用。
一，木薯粉
1，木薯粉又称泰国生粉。是一种淀粉的名称，一种热带植物的块根中提取的淀粉，这种植物属大槭科，与蓖麻，橡胶，小桐子同科。它在加水遇热煮熟后会呈透明状，口感带有弹性；
2，木薯粉是用树薯粉做成的小圆球，而树薯粉则是从树薯或木薯植物（Manihot esculenta）的根部精炼所得的淀粉。它是婴儿食品牛奶布丁的主要成分，也用来使汤汁及炖菜变稠。
二，麻薯粉
1，麻薯粉是一种起源于台湾，日本并广为流行的传统食品，在大陆俗称糯米团。传统的麻薯是由糯米粉蒸熟后包陷做成，配料、工序复杂；
2，麻薯粉采用优质的糯米粉和多种变性淀粉，畏以特殊改良工艺与进口改良剂，合成品不但便于操作，更具有冰滑爽、不粘牙、糯和软筋、甜度低、无颗粒感的特色，冷冻保藏和室温保藏均不易老化，在合适的工艺及保存条件下保质期可达6个月；
3，麻薯粉使用范围比较广泛，比如麻糬、大福、糯米团、雪媚娘、和果子、年糕等中式、西式糕点的制作。
1、原料不同
麻薯粉是用糯米粉或者其它淀粉制成，木薯粉则是由树薯或木薯植物根部炼得的淀粉，从原料上来看麻薯粉更为广泛，木薯粉则相对来说要单一些。
2、作用不同
麻薯粉不是婴儿食用牛奶布丁的主要原料，而木薯粉遇热呈透明状，口感Q弹，是婴儿食用牛奶布丁的主要原料，用它来给汤汁勾芡也可以，麻薯粉中的糯米粉则不适合给汤汁勾芡用。