1、木薯粉与木薯淀粉的来源不同，木薯粉主要是从木薯中提取的，先将木薯打皮之后，然后粉碎，进行一段时间的烘干，最后得出了颗粒状的粉末。木薯粉都是由作坊生产的，加工时比较简单，并且木薯的价格也不是很高。
2、相对比较木薯淀粉在加工时要比较复杂一点，需要使用流水线进行加工，最终才能得到木薯淀粉。其过程有去皮，清洁，粉碎，进行筛选，深层过滤，浓缩提取，进行脱水，定时烘干，最终还要进行筛分。最终才能够得到非常细腻的木薯淀粉。
能够看出木薯淀粉在加工时，的确要比木薯粉增加了很多步骤，所以木薯淀粉的品质会更高。木薯淀粉要通过生产线去生产，所以成本也会随之增加。在生活中使用时大家一定要进行区分，因为两种不同的物质所起的作用也不同。
工艺不同：木薯粉是将木薯去皮后，进行粉碎、烘干得出的粉状颗粒，亦或是去皮、晾干后进行粉碎得到的粉状颗粒，一般都是由家庭式作坊生产。木薯淀粉是经过整条流水线加工得到的淀粉，加工工艺较为复杂，包括了去皮、清洗、粉碎、筛分、过滤、浓缩、脱水、烘干、筛分等，从而得到的细腻、高质量的粉状颗粒，一般都由工业流水线生产。（
用途不同：木薯粉一般为粉状颗粒，加水遇热煮熟后会呈现出透明状，口感Q弹的块状，多被作用于食物加工。木薯淀粉呈现的是一种细腻的粉末状，遇水加热不会成团，一般在炒菜或者做汤时，木薯淀粉都会起到收汁作用。
生熟差别：木薯粉与木薯淀粉虽然原材料一样，但加工工艺相差甚大，木薯粉加工粗糙，相对保留了木薯的毒性，所以木薯粉是不能生吃的，它里面含有的氢氰酸，会危害健康，而木薯淀粉加工精细，在加工过程中就已经去除了木薯中存在的有毒物质。因此木薯粉不能生食而木薯淀粉可以直接使用